基因组研究报告：从犬类肿瘤，蚊子小型RNA等方面了解人类乳腺癌

由普林斯顿大学和宾夕法尼亚大学领导的团队分享从转录组测序和分析中收集的见解人乳腺癌的犬乳腺肿瘤（CMT）模型与肿瘤发展。借助RNA测序和称为“跨物种表达分析框架”（FREYA）的分析管道，研究人员在22个恶性乳腺样品，41个良性肿瘤样品和两个以上的恶性肿瘤样品中分析了基因表达模式并寻找体细胞突变。从16个不同品种的狗中获得十二个匹配的正常样本。他们报告说：“总的来说，我们的研究在分子水平上证明了人类乳腺癌和犬乳腺肿瘤的相关性，以及CMT模型用于识别其他模型系统中所掩盖的信号的效用。”为人类临床和体外提供有力的补充 研究以及模型生物研究。”

美国和英国的研究人员报告了少量的RNA资源它将转座子和与病毒相关的小RNA数据汇总在一起，以收集来自四个医学上重要物种的蚊子的信息，这些物种以致病性虫媒病毒和其他人类感染的传播而闻名。研究小组写道，“蚊子小RNA基因组学”（MSRG）系列“捕获了蚊子细胞培养物中的体细胞和性腺小RNA表达谱。” 例如，作者使用MSRG追踪piwi相互作用RNA（piRNA）的生物发生，同时研究了piRNA与小干扰RNA的相互作用，并确定了蚊子中保守的piRNA簇。他们报告说：“ [我们的数据表明，体细胞piRNA和siRNA可能是对持续虫媒病毒感染的昆虫媒介反应。”

最后，来自伊利诺伊大学香槟分校，卡内基梅隆大学和加利福尼亚大学伯克利分校的研究小组介绍了基于酪酰胺信号放大（TSA）-seq的分析结果三维基因组组织的研究，着眼于所谓的核斑点或信使前RNA剪接因子富集的间质染色质颗粒簇。基于对几种人类细胞系进行的一系列TSA-seq分析，研究人员发现核斑点之间的距离和细胞类型特异性基因表达之间存在明显联系，核斑点与热休克相关基因座之间的物理距离也很明显。他们写道：“我们的结果表明，很大程度上是'硬连线'的基因组组织，其特定基因在细胞分化或生理转变过程中相对于斑点移动的平均距离较小，提示核斑点在基因表达调控中的重要作用。”